Kunnan luottamuselinorganisaation muodostavat: kunnanvaltuusto, kunnanhallitus, sivistyslautakunta ja sen kielijaostot, tekninen lautakunta, keskusvaalilautakunta, tarkastuslautakunta
Kunnanvaltuusto käyttää kunnassa korkeinta päätösvaltaa. Myrskylän kunnanvaltuustossa on 15 kuntavaaleilla valittua valtuutettua.
Kunnanhallitus johtaa kunnan hallintoa, taloutta ja toimintaa valtuuston päättämän kuntastrategian mukaisesti. Apunaan näissä tehtävissä kunnanhallituksella on sen alaisuudessa toimiva kunnanjohtaja. Myrskylän kunnanhallituksessa on seitsemän jäsentä.
Lautakunnat johtavat ja kehittävät alaistaan toimialuetta.