Kommunens förtroendeorgan består av: kommunfullmäktige, kommunstyrelsen, utbildningsnämnden och dess språksektioner, tekniska nämnden, centrala valnämnden och revisionsnämnden
Kommunfullmäktige har den högsta beslutanderätten i kommunen. Mörskom kommunfullmäktige består av 15 ledamöter som väljs i kommunalvalet.
Kommunstyrelsen leder kommunens förvaltning, ekonomi och verksamhet i enlighet med den kommunstrategi som fullmäktige har beslutat om. Som stöd i dessa uppgifter har kommunstyrelsen en kommunchef som arbetar under dess ledning. Myrskyläs kommunstyrelse består av sju ledamöter.
Nämnderna leder och utvecklar sina respektive verksamhetsområden.